När RCS skickas i Google Messages mellan två Androidenheter är meddelandena end-to-end-krypterade, så ingen annan kan ta del av kommunikationen. RCS-meddelanden mellan Android och IOS är dock öppna och osäkra men det kommer bli ändring på den saken.

GSMA har officiellt lagt stöd för end-to-end-kryptering (E2EE) till RCS genom protokollet Messaging Layer Security (MLS). Både Google och Apple har bekräftat att företagen kommer implementera krypteringen för RCS mellan plattformarna, så säkerheten inte blir lidande bara för att ett meddelande skickas från ett operativsystem till ett annat.

Stödet för RCS är dock knapert bland svenska operatörer. Just att operatörer tog tid på sig att implementera RCS, samt att amerikanska operatörer skapade egna inkompatibla lösningar, är anledningen till att Google bestämde sig för att strunta i operatörerna och implementera RCS på egen hand.